冷却塔经常出现结垢、腐蚀性物质沉淀、锈蚀、军事细菌、细菌和藻类等污染问题。然而，冷却塔的清洁和维护往往是一个讨论的话题。为什么会出现冷却塔污染?的专业技术人员分析了冷却塔污染的原因：
冷却塔在日常应用中全是曝露在空气中，空气中有大量的悬浮液、尘土、杂质会持续的堆积在冷却塔中，因此冷却塔会出現污垢沉定。制冷水系统软件中也会滋长很多生物藻泥，导致阻塞状况。
在冬天，冷却塔很少使用。冷却塔内会积聚大量的水分，冷却塔内的水分会对冷却塔内部产生一定的腐蚀。随着时间的推移，腐蚀性物质会积聚，导致局部腐蚀非常严重。
冷却塔循环水中含有无机盐、有机物质和微生物等，在某些季节水温可达35℃以上，如果长时间使用冷却水不更换或补充水量不足，以及长时间不清洗消毒或消毒不彻底，就会滋生大量细菌，其中典型的细菌是军团细菌，这些细菌会引起传染病。冷却塔的冷却水中有大量的微生物气溶胶，有些直接浮到冷却塔周围的空气中，影响了周围800米。因此，城市冷却塔是城市污染的主要来源之一。
